凌云县博物馆新馆位于凌云县城东后龙山脚下（中山纪念堂旁）。为了改变原博物馆地处偏僻、面积小、馆舍陈旧，无法满足公众参观需求的状况，凌云县人民政府决定利用享受民族自治县待遇20周年的资金，搬迁重建博物馆。新馆于2013年5月正式动工，占地面积4503平方米，建筑面积3421平方米，其中展厅面积2086平方米，库房面积429平方米，总投资900万元（其中：中央补助600万元，县出资300万元和配套土地）。博物馆新馆于2016年1月建成正式对外开放。

新馆建筑外表古朴典雅、规模宏伟，共分为三层，第一、第二层为展厅、库房、办公室及各功能室，第三层为钟鼓楼。展览分为序厅、泗城记忆、多彩民俗、革命烽火、生态家园、凌云巨变、乡镇风采、铜钟楼展示区八大部分，通过实物、雕塑、实景还原、影像、图片、绘画等方式，来展现凌云“千年州府”的厚重历史，多彩纯朴的民风名俗，波澜壮阔的革命斗争史，以及改革开放后，凌云经济社会发展取得的成就。

博物馆新馆是凌云县委、县政府推进和谐凌云建设的一项重要文化惠民工程，新馆的建成，是凌云文化发展史上的一件大喜事，标志着凌云县文化事业进入了一个新的发展阶段，对于进一步丰富人民群众的精神文化生活，推动凌云文化大发展大繁荣，开展凌云文化旅游，促进凌云经济社会和谐发展具有深远的意义。